乙肝表面抗原（HBsAg）是乙肝病毒的外殼蛋白，本身不具有傳染性，但它的出現常伴隨乙肝病毒的存在，所以它是已感染乙肝病毒的標志。它可存在於患者的血液、唾液、乳汁、汗液、淚水、鼻咽分泌物、精液及陰道分泌物中。在感染乙肝病毒後2～6個月，當丙氨酸氨基轉移酶升高前2～8周時，可在血清中測到陽性結果。急性乙型肝炎患者大部分可在病程早期轉陰，慢性乙型肝炎患者該指標可持續陽性。
乙型肝炎表面抗體（抗-HBs）一般簡稱表面抗體。當乙型肝炎病毒侵入人體後，刺激人的免疫系統產生免疫反應，人體免疫系統中的B淋巴細胞分泌出一種特異的免疫球蛋白G，就是表面抗體，它可以和表面抗原特異地結合，然後在體內與人體的其他免疫功能共同作用下，可以把病毒清除掉，保護人體不再受乙肝病毒的感染，故稱表面抗體為保護性抗體。有了表面抗體，證明人已產生了免疫力。人自然感染後或注射乙肝疫苗後，均可產生乙型肝炎表面抗體；但不是所有的人都能產生表面抗體。一般成人期感染乙型肝炎病毒，可以發生急性乙型肝炎，也可沒有症狀，絕大多數在3～6個月以後才出現表面抗體。檢查出抗-HBs陽性，疾病即已逐漸恢復。血液裡表面抗體能維持很長時間，直到老年期抗體水平才有所降低。若在嬰兒期感染乙型肝炎病毒，往往不產生表面抗體，而持續攜帶表面抗原，有時經過若干年後出現抗-HBs，而乙型肝炎表面抗原就慢慢轉陰了。所以，如查出抗-HBs陽性結果，就表示不會再感染乙型肝炎了。
乙型肝炎e抗原（HBeAg），一般通稱e抗原。它來源於乙型肝炎病毒的核心，是核心抗原的亞成分，或是核心抗原裂解後的產物。e抗原是可溶性蛋白。當核心抗原裂解時，可溶性蛋白部分（即e抗原）就溶於血清中，存在於血液循環中，若取血化驗就可查出來。核心抗原在病人血清中查不到，僅在肝細胞中才能查到。故查出e抗原，其意義就等於查出核心抗原，表示病毒復制活躍，並且傳染性較強。一般HBsAg(＋)的人，用比較敏感的固相放射免疫法檢查e抗原，可有61%的人HBsAg(＋)。而如果HBsAg(＋)，其意義與在血中存在病毒顆粒，或在血中查出乙型肝炎病毒DNA或核心抗體IgM相同。
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