目前認為，乙肝病毒的持續感染是造成乙肝慢性化的根本原因，因此抗病毒治療是慢性乙肝治療的關鍵。
一、哪些病人應該抗病毒治療確診為慢性乙型肝炎的病人，如果轉氨酶升高或者肝活檢證實肝組織有明顯慢性炎症，同時血清乙肝e抗原、HBV-DNA陽性者，都應該進行抗病毒治療。
如果轉氨酶正常並且肝活檢未發現肝組織有明顯炎症活動，雖有血清e抗原或者HBV-DNA陽性，只表明是乙肝病毒攜帶者或者是慢性乙肝靜止期，暫時不必抗病毒治療，但需要定期到醫院復查。一旦出現轉氨酶異常再及時治療。
二、治療應該達到什麼樣的效果治療中，很多慢性乙肝病人片面追求轉氨酶恢復正常或者HBV-DNA轉陰。實際上，慢性乙肝進行抗病毒治療的目標包括：①近期目標：即療程結束時，肝功能恢復正常，HBV-DNA轉陰，並且出現血清轉換（指e抗原轉陰，e抗體轉陽）。醫學上稱之為“完全應答”。出現完全應答，是慢性乙肝抗病毒療效顯著的標志。②遠期目標，即療程結束後，改善長期預後，預防和逆轉肝纖維化和肝硬化的發生，並明顯降低肝細胞癌的發生率。所以，對抗病毒治療效果的判定應全面化。
三、如何選擇抗病毒藥物
首先，病人要明確自身的病情，凡是被確診為慢性乙肝活動期的病人（即轉氨酶升高或者肝活檢證實肝組織有明顯慢性炎症，同時血清乙肝e抗原、HBV-DNA陽性者），均應進行抗病毒治療。其次，充分了解抗病毒藥物的種類、作用機制、適應症、療效、副反應等，根據病情選擇不同的抗病毒藥物。最後，也要考慮藥物的品牌、藥廠的信譽、售後服務等方面的情況。
目前，國內外醫學界所公認的治療慢性乙肝有確切療效的抗病毒藥物主要有兩大類：α干擾素和核苷類似物。α干擾素如賽若金（α1b干擾素）、α2a、α2b干擾素等。核苷類似物如拉米夫定、泛昔洛韋等。
1、α干擾素
α干擾素具有抗病毒和免疫調節雙重作用，迄今用於治療慢性乙肝有近30年的歷史，經驗非常成熟，療效確切。它是國際公認的治療慢性乙肝的首選抗病毒藥物之一，並且目前仍是唯一被認可對慢性乙肝有明確的長期療效的藥物。
α干擾素的用量一般是每次30～50微克（α1b干擾素），或300～500萬IU（α2干擾素），起始治療為每天一次，兩周後改為隔天一次，肌肉或皮下注射，療程六個月。α干擾素治療六個月後，40～50％病人達到完全應答，表現為肝功能恢復正常，HBV-DNA轉陰，出現血清轉換，並且療效長期穩定。有資料顯示，慢性乙肝經α干擾素治療後可延緩病情進展，預防或降低肝硬化、肝癌的發生率，提高生活質量。
我國科學家發現，中國人感染病毒後，白細胞產生的α干擾素主要是α1b型干擾素，因此α1b干擾素尤其適合中國人使用，它更符合中國人的自然狀態，副作用低。我國由深圳科興公司生產的α1b干擾素（商品名為賽若金），現已成為肝炎抗病毒治療的主要藥物之一。
2、核苷類似物
核苷類似物中代表藥物是拉米夫定。拉米夫定能抑制乙肝病毒復制，但缺乏免疫調節功能。拉米夫定在用藥的早期能迅速抑制乙肝病毒，使血清HBV-DNA水平很快下降。但是，該藥的完全應答率不太理想，治療1年約20％的病人達到完全應答，但停藥後容易復發。另外，拉米夫定用藥超過六個月就有可能會引起病毒變異，病毒變異的發生率隨著用藥的時間有遞增的趨勢。
總之，慢性乙肝的抗病毒治療是一項科學性很強的醫療“工程”，因此必須在有經驗的臨床醫生指導下進行。同時，醫生和病人之間應密切合作，重視復查、隨訪，讓醫生能及時了解治療反應，必要時調整治療方案。
