乙肝病毒最常用的血清學標志是: 乙肝表面抗原(hbsag)、乙肝表面抗體(抗-hbs)、乙肝e抗原(hbeag)、乙肝e抗體(抗-hbe)、乙肝核心抗體(抗-hbc)。即兩對半，或稱乙肝病毒5項。
(1)乙肝表面抗原：是乙肝病毒的外殼蛋白，本身不具有傳染性，但它的出現常伴隨乙肝病毒的存在，所以它是已感染乙肝病毒的標志。它可存在於患者的血液、唾液、汗液、淚水、鼻咽分泌物、精液及陰道分泌物中。在感染乙肝病毒後2～6月，當丙氨酸氨基轉移酶升高前2～8周時，可在血清中測到陽性結果。急性乙型肝炎患者大部分可在病程早期轉陰；慢性乙型肝炎患者該指標可持續陽性。
(2)乙肝表面抗體：是對乙肝病毒免疫和保護性抗體。常在乙型肝炎恢復後期出現陽性。此時乙肝表面抗原已轉陰數月。血清中乙肝表面抗體滴度越高，保護力越強，持續時間也越長(3～5年以上)。再次感染乙肝病毒後,乙肝表面抗體可在2周內滴度明顯升高。但也有乙肝表面抗體陽性而又發生乙型肝炎者,這種情況可能為不同亞型感染。90%接受乙肝疫苗注射者的乙肝表面抗體可轉陽。極少數情況下表面抗原和抗體均為陽性，常見於不同亞型的乙肝病毒感染；免疫功能低下的患者，血液中的乙肝表面抗原；或是感染了s基因發生了變異的乙肝病毒。
(3)乙肝e抗原：在乙肝病毒感染後表面抗原陽性同時或其後數日可測得乙肝e抗原。乙肝表面抗原在血內高峰期亦是乙肝e抗原的高峰期。在肝炎症狀出現後10周內逐漸下降，在乙肝表面抗原轉陰前可先轉陰。如果乙肝e抗原陽性，則可發展為慢性持續性感染。乙肝e抗原陽性說明乙肝病毒在體內復制活躍，傳染性強。在慢性乙型肝炎患者中，乙肝e抗原指標轉陰而乙肝e抗體轉陽過程中臨床上可出現明顯的肝功能惡化。極個別情況下可見乙肝表面抗原陰性而乙肝e抗原為陽性。
(4)乙肝e抗體：在乙肝e抗原轉陰後數月出現乙肝e抗體陽性。乙肝e抗體陽性預示患者的傳染性已顯著或相對降低。病毒復制程度已降低或明顯緩解。近年發現個別乙肝e抗體陽性，但乙肝病毒核糖核酸(hbvdna) 亦為陽性者的病情遷延不愈，這是感染了變異的乙肝病毒所致，臨床上不可忽視。
(5)乙肝核心抗體：通常在乙肝表面抗原出現後3～5周肝炎症狀出現前即可在血清中檢出。高滴度的乙肝核心抗體陽性常標志乙肝病毒正在復制，有傳染性。可持續存在數年至數十年。低滴度的乙肝核心抗體表示乙肝病毒既往感染。
