因為介入治療也灌注化療藥，因此具有與全身化療差不多的化療藥物的毒副作用，這是我們通常見的毒副作用，比如惡心、嘔吐，血相的降低，骨髓抑制這些情況存在。
跟介入治療特別相關的毒副作用主要是栓塞引起的，因為栓塞不是其他治療能做到的。
跟栓塞相關的毒副作用就是栓塞術後綜合症，因為包括惡心、嘔吐、發燒、疼痛，主要是這四種情況。它的惡心、嘔吐也跟打化療藥物有相關性。但是通過我們的研究表明，如果你做了栓塞之後，他的惡心嘔吐可能有所加重，因為栓塞綜合症帶來的。跟栓塞相關的主要是發燒和疼痛。發燒和疼痛因為腫瘤的供血動脈很豐富，我們打了栓塞劑，讓腫瘤供血動脈封閉了，閉塞了，這些腫瘤急性缺血和栓塞之後急性缺血造成的壞死，這些情況造成的患者疼痛和發燒。這個情況大概要持續三到五天。這是跟栓塞和介入治療比較相關的栓塞術後綜合症，這是比較特殊的毒副作用。
對於這些副作用，一般的肝癌患者都可以耐受，通常發燒在38度左右，很少部分患者會高燒，大部分患者都在38到39度之間，這樣經過一般的處理，患者很快都能夠恢復。
