目前臨床上應用的乙肝疫苗主要有以下幾種：
(1)血源性乙肝疫苗：此疫苗是用無症狀的HBsAg攜帶者的血液制成，故稱血源性乙肝疫苗。它的制備步驟大致是：采用高滴度HBsAg陽性攜帶者血液，分離出血漿並除去其中有感染的HBV顆粒後，再將HBsAg予以濃縮與純化，充分滅活，以消滅其中可能存在的一切已知病毒和消除HBsAg表面可能存在的全部宿主蛋白，然後添加佐劑及防腐劑而成。為確保疫苗的安全，每一階段均取樣做無菌試驗、熱源試驗及動物安全試驗等，以檢查疫苗中有無其他病原體及血液中的抗原物質。此種疫苗的免疫原性與安全性均已獲得解決，但尚有一些缺點：① 為防止可能存在的某些病原體在制備過程中逃避滅活，采用了嚴格、復雜且費時的物理與化學方法純化HBsAg抗原與滅活措施，使制備成本提高而疫苗產量不高；②隨著乙肝疫苗長期而廣泛的使用，無症狀HBsAg攜帶的數目勢必逐漸 減少，最終將難以再用他們的血液制備疫苗。
(2)基因工程疫苗：利用基因工程研制重組DNA乙肝疫苗，曾先後研制過大腸桿菌系統、啤酒酵母細胞系統、哺乳動物細胞系統和牛痘病毒系統的重組乙肝疫苗。目前多用酵母基因的重組疫苗。其具有良好的免疫原性，免疫應答特點與血源性乙肝疫苗基本相似，且多無嚴重的不良反應。盡管它含酵母蛋白不超過1%，但對其產生變態反應的擔憂尚未完全排除。
(3)含前S蛋白的乙肝疫苗：目前臨床上應用的血源性疫苗與基因工程疫苗，均只含HBsAg蛋白，當證實S蛋白能增強HBsAg的免疫應答後，又注意到單純只含HBsAg蛋白的疫苗對血液透析病人與新生兒免疫效果較差時，遂生產出添加前S蛋白的酵母源性重組乙肝疫苗，它確能明顯地增強免疫應答。
